全电差额征税是指企业在进行跨区域业务时，按照税负差额征收的增值税。开具全电差额征税的发票时，需要进行相应的分录处理，一般需要分为两个科目进行处理。

具体分录如下：

1. 增值税应纳税额科目借方：全国销售额×13%（销售额包括不含税销售额和增值税税额）。

2. 应交税金—增值税科目贷方：销售额（不含税销售额和增值税税额）×（跨地区税负差额×70%）。

以上是全电差额征税的一般会计分录，具体操作应根据企业实际情况进行调整。同时，建议您在开具发票前，咨询专业的财务顾问或税务师，以避免出现税务问题。