新车年底落户和跨年落户的主要区别在于车辆的注册日期和保值率。

如果在年底前落户，车辆的注册日期就是当年的，而如果跨年落户，车辆的注册日期就会是下一年的。这可能会对车辆的保值率产生一定的影响，因为车辆的年限是以注册日期为准的。

此外，不同地区也可能会有一些政策上的区别，例如一些地区可能会对跨年落户的车辆征收更高的税费或者限制车辆的使用等。

因此，如果您考虑购买新车并落户，建议您在年底前尽快办理落户手续，以避免不必要的麻烦和费用。同时，您也可以咨询当地的车管所或者相关部门，了解具体的政策和规定。