南京小区起火的电动车车主是否负责，这取决于起火的原因。如果电动车起火是因为产品缺陷导致的自燃，那么厂家应该承担责任。然而，如果起火原因不是产品缺陷，那么车主可能需要承担责任。
此外，如果电动车失火造成了人员伤亡和经济损失，可能会构成失火罪和消费责任事故罪，需要追究刑事责任。即使没有造成人员伤亡，情节较轻的情况下，车主也可能面临拘留和罚款的处罚。根据相关法律规定，过失引起火灾尚不构成犯罪的，处十日以上十五日以下拘留，并处五百元以下罚款；情节较轻的，处警告或者五百元以下罚款。
总的来说，电动车车主作为直接侵权责任人，通常需要承担民事侵权损害赔偿责任，并可能面临行政处罚和刑事处罚。但具体情况还需根据起火原因和相关法律规定来判断。