如果骨折医疗费用超过了免赔额，那么保险公司会对免赔额以上部分进行报销。也就是说，如果免赔额是5000元，而实际医疗费用是10000元，那么保险公司将对超过免赔额的5000元进行报销。报销金额通常受到赔付比例、限额等因素的限制，具体报销金额还需要根据保险条款和具体情况来确定。

另外需要注意的是，一些百万医疗险产品可能对特定的医疗费用进行部分或全部免赔，比如手术费、器材费、药品费等。因此，在购买百万医疗险时，需要仔细阅读保险条款，了解保险保障的范围和免赔额等相关信息。