未拆封的手工巧克力棒棒糖，其保质期在恰当的存储条件下，通常可以达到两年，其中纯巧克力和复合型巧克力的保质期分别约为两年和一年。如果棒棒糖已经拆封，建议在良好的保存环境下尽快食用完毕。然而，如果在巧克力中添加了鲜奶油等成分，比如含有甘纳许（融化的巧克力配上鲜奶油做成的巧克力馅料）的松露巧克力、生巧克力等等，不添加防腐剂的话，它们的保质期非常短，一般在1-2周，而且最好将储存温度保持在15-18°C。此外，巧克力的保存条件通常是湿度低于55%的干燥环境。

冬天气温较低时，可储存在阴凉通风的地方；夏天温度较高时，为防止巧克力融化，可以将其存放在冰箱中。