一般来说，蘑菇的生产是不能使用农药的，但是一些特殊情况下，例如双孢菇，采收后可能会有人使用焦亚硫酸钠处理，这样就会有硫的残留。对于市场上颜色特别白的蘑菇，不建议购买。
香菇是一种低级生物，生长速度快，代谢能力低，不能代谢部分农药，所以在食用前需要充分清洗。
然而，现在的多数农药是高效低残留的，半衰期很短，所以也不必过度担忧农药残留。人工种植的香菇需要人工干预，如施肥施药，但是菌孢和没放进大棚以前只是喷撒在土上极淡一点，而菌孢接触地面只是小拳头大小一点点，所以不必担心农残。
总的来说，菇类的农药重金属残留情况因养殖方式和环境而异，消费者在购买和食用时需要注意。