赤芍断面为什么是紫色，可能有几个因素。

首先，赤芍的含有芍药素，这是一种黄酮类化合物，它具有很强的抗氧化性质，因此能够抵消过氧化物和其他有害自由基。

当芍药素和其他生物碱暴露在空气中时，它们可能会与氧气发生反应，从而产生深紫色的化合物。

此外，该颜色可能还与植物的生长条件和环境有关。例如，受到紫外线或其他干扰因素的草药可能会产生更多的紫色生物碱，在某种程度上影响到了赤芍抽样的颜色和外观。

因此，赤芍断面紫色的原因可能是由于多种因素的复杂作用所致。