医药公司要做好财务内部管理，首先需要建立健全的财务制度和流程，确保财务活动的规范性和透明度。

其次，要加强财务风险管理，包括合理控制成本、降低财务风险、加强内部控制等。同时，要加强财务数据的分析和监控，及时发现问题并采取相应措施。

此外，要加强财务团队的培训和专业能力提升，确保财务人员具备良好的专业素养和业务水平。

最后，要加强与其他部门的沟通与协作，形成良好的内部合作机制，共同推动财务管理的优化和提升。