如果门禁一体机的母卡丢失了，首先要立即通知相关部门进行挂失，确保不会被不法分子利用。然后要尽快补办新的母卡，并进行重新绑定与激活，以保证门禁系统的正常运行和安全性。同时，要加强对门禁卡的管理和使用，避免类似情况再次发生，确保门禁系统的稳定和安全。