惠州工程职业技术学院拥有多个王牌专业。

首先是机电工程技术专业，该专业是学校的特色专业，培养了许多具有实践经验的高素质机电工程技术人才，在企业需求量大。

其次是建筑工程技术专业，学校为该专业建立了完善的实验室和科研基地，培养了一大批优秀的建筑工程技术人才，可以为建筑行业提供优秀的技术支持。

另外还有软件技术专业、汽车应用技术专业、物流管理专业等王牌专业，与市场需求高度贴近，培养了大量优秀的人才，得到了广泛的认可和好评。