有两个方面的区别；1、国家名称与民族的区别，元是一个朝代的名称，而蒙古帝国，指的是以蒙古族为主而组建的国家。

2、地域方面的区别，元是一个大一统的王朝，其疆域面积涵盖中原，蒙古，亚洲，欧洲的一些区域。蒙古，泛指的是蒙古高原地区。