谷子过海关不会被扣。因为谷子是一种常见的农产品，没有违反任何国际贸易规定或行业标准。而且，谷子不属于危险品或受控制的物品之列，所以过海关不会被扣留。但是，需要注意的是，如果谷子没有按照海关要求进行相关申报或未经检验合格，就有可能被海关扣留或没收。

因此，作为出口商或进口商，在出口或进口谷子时，一定要了解相关的法律法规和海关要求，确保遵守规定，才能顺利过海关。