结构不同：自花授粉的花朵同时拥有雄蕊和雌蕊；异花授粉的花朵雄蕊和雌蕊不在同一个花朵中。

特点不同：自花授粉的花朵授粉后，稳定性更高；异花授粉的花朵适应性更强，遗传性更丰富。

传粉方式不同：自花授粉的植物，只能将花份传在同一朵花上，异花授粉的植物，能够将花传到其他植株的花朵上。

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