叔叔的户口落在侄子的宅基地上，首先需要依据当地的宅基地管理规定，按照该宅基地的合法使用范围，合理安排宅基地的使用。处理这种情况时，应确保双方的权益得到保障，并遵循相关法律法规。

如果宅基地的使用权已经明确划分，可以考虑将宅基地进行分割，并分别登记在叔、侄两户名下。这样可以明确双方对宅基地的使用权，避免产生纠纷。

如果宅基地的使用权没有明确划分，需要叔、侄双方协商一致，确定各自在宅基地上的权益和使用范围。双方可以签订书面协议，明确宅基地的划分、使用方式等具体事项，以确保双方的权益得到保障。

如果双方无法达成一致，或者存在其他纠纷，可以寻求法律途径解决。可以向当地土地管理部门或法律机构咨询相关政策和法律规定，以便更好地维护自己的权益。

在处理此类问题时，建议叔侄双方保持沟通，相互理解，共同寻找合理的解决方案。同时，也应遵守相关法律法规，确保处理过程合法合规。