一般农田建小型养殖场要申请土地使用证和环境影响评价报告，确认场地的合法性和环保性。然后需要在当地农业、畜牧、水利等部门进行备案或注册登记，获得相关的养殖证或执照。此外，还需要遵守国家和地方的相关法律法规和标准，如环保、卫生、消防等方面的要求。