农村平房房顶起皮通常是由于长期的雨淋和阳光曝晒导致的，可以采取以下方法进行处理：

1. 先清理房顶的陈旧瓦片、破损的部分等杂物，保持房顶表面干净。

2. 使用刷子和清水彻底清洗房顶，去除积尘和杂物。

3. 检查房顶漏水情况，如果有漏水现象需要及时修补，保证房顶的密封性。

4. 使用专门的房顶防水涂料或者涂料进行喷涂或者涂刷，修复房顶起皮的部分，并在房顶上一层一层地覆盖，确保房顶防水。

5. 定期对房顶进行维护，及时修复破损部分，防止再次起皮。

如果以上方法不能解决问题，建议咨询专业的建筑工程师或者房屋维修工人进行检查和处理，以确保房顶的安全和耐用性。