四方协议和三方协议的主要区别在于签约主体的数量和角色。四方协议是由四个签约主体共同签订的协议，常见于普通民事合同和经济合同，四方都有法律意义上的权责。而三方协议则常见于未毕业学生和用人单位之间的协议，通常涉及学校、毕业生和用人单位三方。此外，三方协议还包括了毕业生就业协议，是明确毕业生、用人单位、学校三方在毕业生就业工作中的权利和义务的书面表现形式。

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