解除劳动合同通知书、解除劳动合同协议书和离职申请书是三种不同的文件，它们之间有以下区别：

1. 解除劳动合同通知书：由雇主向劳动者发出的，以通知劳动者雇用关系即将终止并规定解除日期和理由的文件。该文件通常是在雇主单方面决定结束雇用关系时使用的。

2. 解除劳动合同协议书：是由雇主和劳动者共同签署的协议书，双方协商一致终止劳动关系并对解除事宜达成一致的文件。

3. 离职申请书：是由员工向雇主提交的申请书，即劳动者主动提出离职申请并说明离职原因及日期的文件。