南京林业大学最好的专业是园林、林产化工、木材科学与工程、机械设计制造及其自动化、农林经济管理、森林工程。这些专业都是国家级特色专业。排名，南京林业大学的林学和林业工程都是全国排名前两名的，风景园林学全国排名前五的。