在《暗区突围》游戏中，机密保险箱和普通保险箱的主要区别体现在以下方面：

物品价值：机密保险箱中的物品价值通常更高，可能包含更为稀有或者贵重的道具，如金物品等。而普通保险箱虽然也可能包含一些有价值的物品，但整体价值通常不如机密保险箱。

刷新位置：机密保险箱的刷新位置通常比较隐蔽或者难以到达，需要玩家付出更多的努力才能找到。而普通保险箱的刷新位置则相对较为常见，玩家可以更容易地找到它们。

开启方式：机密保险箱通常需要特殊的道具或者技能才能开启，这也增加了获取其中物品的难度。而普通保险箱则通常可以直接开启，无需特殊道具或技能。

总的来说，机密保险箱在《暗区突围》游戏中具有更高的价值和挑战性，而普通保险箱则更加常见和易于获取。玩家可以根据自己的需求和实力选择适合自己的保险箱进行探索。