申通不完全是阿里系的，但是阿里在申通有大多数股份，目前是申通的大股东。

阿里旗下的菜鸟已拿下申通25%股份，2023年6月6日，申通快递一则公告引起资本市场的注意，其大股东德峨实业将持有的3.83亿股（占总股本的25%）转让给菜鸟供应链，菜鸟供应链是菜鸟网络的全资子公司，这意味着菜鸟网络将拥有申通快递25%的股份，成为后者第一大股东。

申通的业务是高度依赖阿里巴巴体系的，双方为了绑定关系，阿里入股申通是一件水到渠成的事情。