添加机动车数码发票专用发票商品编码需要在增值税专用发票管理系统中进行操作。首先，登录增值税专用发票管理系统，进入商品编码维护页面，点击“添加商品编码”按钮。

然后，填写商品编码、商品名称、规格型号等信息，选择商品的分类和税率，并保存。

如果添加的是机动车数码发票专用发票商品编码，则需要选择“增值税专用发票”作为发票类型。保存后，该商品编码就可以在开具机动车数码发票专用发票时使用了。