一般情况下，已经通过支付宝支付的医疗费用是不能再进行医保报销的。医保报销一般是针对通过医院或医疗机构特定的支付渠道并符合相应规定的费用进行的。如果您通过支付宝支付了自费医疗费用，一般情况下是无法再通过医保报销这部分费用的。但具体情况还需根据所在地的医疗政策和规定来确定，建议您咨询当地的医保机构或相关部门进行确认。