如果新生儿因重大疾病住院治疗，可以按规定报销百分之七十的费用。法律依据:《中华人民共和国社会保险法》 第三十条 下列医疗费用不纳入基本医疗保险基金支付范围:

应当从工伤保险基金中支付的。

应当由第三人负担的。

应当由公共卫生负担的。

在境外就医的。

医疗费用依法应当由第三人负担，第三人不支付或者无法确定第三人的，由基本医疗保险基金先行支付。基本医疗保险基金先行支付后，有权向第三人追偿。

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