以工商备案为准。因为作为一个对外的法律主体，如果仅以企业股东之间签署的股权变更协议对抗不知情的第三方，在法律上是没有效力的。

企业通过注册登记机关作的股权变更，才具有法律效力，而且任何第三方都可以通过全国信用公示系统查询到。