公司账户被法院冻结的处理办法：

1、知悉此事的公司高层、财务人员、主要业务经理，以免再往公司账户里打款。通知范围需要控制，以免引起人心浮动；

2、告知即将为公司打款的客户，协商现金收款，或者打到出纳人员的个人账户里；

3、最根本的是确定冻结原因，若存在经济纠纷可以庭外和解，将银行账户解冻。