蝴蝶兰种子长约0.2-0.3厘米，呈纽扣状，色泽棕褐色。它们包含在花朵的蒂头里，在花期结束后逐渐干燥，最终裂开，释放出种子。蝴蝶兰种子表面粗糙，类似于弹珠。在播种前，需将种子浸泡在温水中6-8个小时，以激发其发芽能力。

种子需要在高湿度（约70-80%）的环境下进行育苗，也可以使用专门的育苗介质，如蕨麻或木炭末。蝴蝶兰种子发芽难度较大且生长缓慢，需要坚持耐心地护理。