茅屋芝士可以用其他的奶酪来代替，例如切达奶酪、帕尔马干酪（Parmesan）、瑞士奶酪等。这些奶酪口感不同，但都有较高的含钙量和丰富的味道。此外，如果需要避免乳制品，可以使用植物性的芝士替代品，如豆腐混合而成的芝士替代品或者纯素奶酪。这些替代品口味也不完全相同，但是它们同样能够为食品增加奶酪风味和质地。