要办理牡丹江食品经营许可证，首先需要准备好相关的申请材料，包括营业执照、食品经营许可申请表、食品安全管理制度等。

然后到当地食品药品监督管理部门或者市场监督管理局进行申请，提交完整的申请材料，并进行相关的审核和审批程序。在审批通过后，就可以领取牡丹江食品经营许可证了。在办理过程中要按照相关法规和规定进行操作，确保所有资料齐全和合规，确保顺利取得许可证。