崇明岛一直限购的主要原因是保护生态环境和防止人口过度集中。崇明岛是上海市唯一的海岛，也是上海市重要的生态屏障。为了保护崇明岛的生态环境，上海市政府于2016年出台了《崇明岛生态保护区开发管理办法》，对崇明岛的开发和建设进行了严格的限制。

同时，为了防止人口过度集中，上海市政府还于2017年出台了《崇明岛户籍管理规定》，对崇明岛的户籍管理进行了严格的限制。