发动机</a>不同：神舟号飞船采用固体燃料作为动力来源，而中国最新研制的新一代载人飞船采用液氧煤油发动机，比冲量比固体火箭发动机大，用氢作为燃料，因此具有重量轻、推力大的特点。
返回舱不同：神舟号飞船的返回舱为密封式，而中国新一代载人飞船的返回舱为开放式。
轨道舱不同：神舟号飞船的轨道舱为密封式，而新一代载人飞船的轨道舱为半密封式。
逃逸救生系统不同：神舟号飞船没有逃逸救生系统，而中国新一代载人飞船配备了逃逸救生系统。
应急救生包不同：神舟号飞船配备的应急救生包重量小、体积小，而中国新一代载人飞船配备的应急救生包重量大、体积大。
发射场不同：神舟号飞船是在酒泉卫星发射中心发射的，而中国新一代载人飞船是在中国文昌航天发射场发射的。
载人不同：神舟号飞船可以搭载一至四名航天员，而中国新一代载人飞船可以搭载三名航天员。
目标不同：神舟号飞船的目标是载人飞行，而中国新一代载人飞船的目标是实现载人航天工程的战略目标。