在记账时，事业单位一次性补偿金的会计分录通常包括以下两个方面：

1. 记录一次性补偿金的支出：

借：一次性补偿金支出（费用类科目）

贷：银行存款（资产类科目）

2. 若已经在负债科目中提前计提了一次性补偿金，则需要对负债科目进行相应的冲减：

借：银行存款（资产类科目）

贷：一次性补偿金负债（负债类科目）

需要注意的是，具体的会计分录可能因单位规模、会计政策等因素而有所不同，建议在具体操作中参考单位的会计准则及税务法规进行处理。